Topik-topik artikel yang termasuk dalam ruang lingkup (scope) jurnal PROTEKSI adalah sebagai berikut.

• Rekayasa dan Teknologi Bidang Kualitas Udara, Air minum, Air Limbah, Limbah Padat dan B3
• Manajemen pengelolaan lingkungan
• Fitoremediasi dan bioremediasi
• Perubahan Iklim
• Monitoring Kualitas Lingkungan
• Energi terbarukan